Seeneriik on läbinud tulnukate sissetungi. Võõrad robotid kõnnivad mööda platvorme ja tänavaid, ähvardades oma raudküünistega kõiki elanikke. Mario on ainus, kes suudab agressorile vastu seista, ta on juba seeni söönud, temast on saanud suur Super Mario, relvastatud haamri ja kividega ning on valmis võitlema. Aita kangelast, ta liigub piisavalt kiiresti ja sina, klõpsates alumises paremas nurgas valitud nuppudele, paned ta kas kive loopima või lööma vaenlast haamriga. Parem on kividega visata suuremate robotite pihta. Ja väikestele piisab tugevast löögist pähe Super Mario Runil.