Õppida on vaja ja see, kes kogu oma teadliku elu uurib, on tark. Kui soovite valitud eriala suurepäraselt omandada, peate selle kõigepealt õppima ja alles seejärel omandama kogemusi omandatud teadmiste praktilise rakendamise protsessis. Õppetöös on oluline, et oleks hea õpetaja, kes mitte ainult ei tea ise palju, vaid saab ka oma teadmisi ja kogemusi nooremale põlvkonnale edasi anda. Chop Chop Ninja Akadeemias lähete akadeemiasse, kus koolitatakse noori ninjasid ja kohtute hallipäise Senesei meistri Chokiga. Mängimise ajal valdavad noored ninjad sõdalase käsitöö ja uskuge mind, see protsess pole lihtne. Kangelased peavad läbima ülesanded, mille õpetaja neile leiutas, ning nad on erineva iseloomu, keerukuse ja sisuga. Koguge vajalik arv münte, hävitage teatud arv koletisi, murrake midagi, tulistage kuskile ja lööge jne. Õppused toimuvad mitte ainult akadeemia territooriumil, vaid ka džunglis, lumistel mäetippudel, külas, jääkoobastes.