Aastakümneid on inimkond hakanud teadma, et Maa kliima muutub ja see on inimese mõjul. Loodus vastab opositsiooni tegevustele ja on mõnikord katastroofiline. Jumalanna Nertia on Maa eestkostja ja ta on väga mures inimeste suhtumise üle ümbritseva looduse pärast. Ta tahab aidata ja taastada looduslikku harmooniat. Selleks peab mängu Earth Whispereris leidma mitmeid iidseid esemeid, mis aitavad tasakaalu taastada, kuid kui inimene jätkab lihtsalt tarbimist, mitte loob, lõpeb see kõigepealt inimeste jaoks halvasti.
