Kujutage ette, et tavaline kirjapliiats jõudis ellu ja püüab nüüd selle ümbritsevat maailma tundma õppida. Meie tegelane otsustas minna korterisse läbitud teekonda ja teid mängides Pen Run aitab tal seda teha. Sinu kangelane peab mööda punktiirjoont, mis on nähtav teie ees. Samal ajal on teie teed kohanud mitmesuguseid takistusi, mida peate neid vältima. Pidage meeles, et mis tahes kokkupõrge toob kaasa teie kangelase kaotuse ja surma.