Muistses Jaapanis kasutati spionaaži ja luure jaoks spetsiaalselt väljaõppinud ninjasõdalasi. Täna saate Ninja Run topelthüppes aidata ühel neist edastada tema tellimuse juhile salajase teate. Teie kangelane jookseb mööda seda teed järk-järgult, saavutades kiiruse. Teel puutub ta kokku mitmesuguste kasulike objektide ja kuldmüntidega, mida ta peab koguma. Samuti puutute kokku mitmesuguste püünistega. Ekraanile klõpsates saate oma tegelasest neist üle hüpata.