Metsasügavuses elab väike naljakas olend nimega Jojo. Ühel päeval kuulis meie kangelane, et öösel ilmuvad kaugetes kohtades kuldmündid. Meie tegelane otsustas minna nendesse kohtadesse ja koguda need kõik kokku. Sina mängus Jojo Run aitad teda selles. Su tegelane jookseb kõigi jalgadega mööda rada. Tee ääres puutub ta kokku maapealsete tõrgete, püüniste ja mitmesuguste olenditega, kes teda tappa suudavad. Kõigile neile ohtudele lähenedes peate panema kangelase hüppama ja lendama läbi selle kogu õhu. Peate kõik need mündid koguda.