Olend nimega Pixelmon elab Minecrafti maailmas. Kuidagi läks meie kangelane riigi kaugematesse piirkondadesse siia elama ja väikelinna ehitama. Teie mängus Pixelmon Craft aitate teda selles. Ekraanil näete enda ees oma tegelast, kes on teatud asukohas. Selle küljel on nähtav väike kaart ikoonidega, mis tähistavad erinevate ressursside asukohta. Teie kangelane peab külastama kõiki neid kohti ja hankima need ressursid. Seejärel alustate spetsiaalse juhtpaneeli abil mitmesuguste hoonete ehitamist meie kangelase vajadustele. Samuti saate luua uusi tööriistu ja relvi.