Hooajalised lahingud algavad Naruto Free Fight: 2. hooajal. Lahingusse astumine: Naruto Uzumaki, Sasuke Uchiha ja Kakashi. Valige kangelane, kellel aitate rivaale alistada ja teid viiakse otse lahingu alguskohta. Mitut vaenlast ründab teie tegelast korraga. Nad tulevad üles ükshaaval, siis rühmiti. ZX-klahvide abil peate võitleja sundima rünnakuid tagasi lükkama ning parem on ennast rünnata ja edasi liikuda, kogudes boonuseid ja läbides tasemeid. Löö oma vastaseid täpse löögi ja löögiga. Kasutage oma erilisi võimeid ainult äärmuslikel juhtudel, kui Naruto Free Fight: 2. hooajal on liiga palju vaenlasi.
