Ninja otsustas taaskord Ninja Samurai Runnerit joosta, et vormis püsida seni, kuni pole konflikte ja pole kusagil oma võitluskunstide oskusi näidata. Kuid tema jooks ei ole ainult treening, vaid ta läheb kohtadesse. Kust leida trofeekulda: münte, sõrmuseid, haruldasi kollaseid kristalle. Seal, kus on midagi väärtuslikku, peab olema ka mingi konks ja see on tõsi. Kangelane peab olema ettevaatlik, sest kulla kõrval võib olla lõhkekehi. Platvormidel hüpates arvutage kaugus, et mitte aktiveerida pommi Ninja Samurai Runneris.
