Ninjadel on Cube Ninjas treenimiseks uued esemed – need on ruumilised mitmevärvilised kuubikujulised kujundid. Need hüppavad ringi ja peaksite olema ettevaatlik, et mitte ühtegi eset vahele jätta, sest möödalaskmine tähendab mängu lõppu. Kui näete ruudustikust koosnevat kuubikut, ärge jätke seda kahe silma vahele, sellel on omadus aega aeglustada. Pärast selle hävitamist. Kõik objektid kukuvad nagu aegluubis ja sa saad veidi puhata, sest edaspidi kasvab Cube Ninjas pidevalt objektide kiirus ja arv.
