Pikslimaailmas on alanud sõda kahe naaberriigi vahel. Liitute selle vastasseisuga mängus Pixel Gunner ja aitate oma kangelasel ellu jääda ja hävitada võimalikult palju vastaseid. Ekraanil on teie ees nähtav teie tegelane, kes on kindlas piirkonnas, relv käes. Ka tema vastased osalevad selles. Peate kangelase nendeni teatud kaugusele viima ja seejärel, olles vaenlase sihikusse püüdnud, avama tule. Täpselt tulistades hävitad vastased ja saad selle eest Pixel Gunner mängus teatud arvu punkte.
