Pixel Mario asub Mario Combatis puhastama Seenekuningriiki oma peamise vaenlase Bowseri käsilaste ülemvõimust. Torumees on pikka aega valmistunud, õppinud erinevaid võitluskunste ja nüüd on aeg neid rakendada. Teie abiga liigub Mario platvormidel hüpates. Teise vaenlasega kohtudes peate ta hävitama rusikate või jalahoopidega. Säästke oma energiat, sest ees on kohtumine peamise vaenlase - Bowseriga ja ta on üsna tugev. Kasutage Mario Combatis liikumiseks nooleklahve ja rünnakuks A-klahvi.