Teatud programm väga reaalse, inimesega väliselt sarnase olendi kehastuses soovib digitaalsest maatriksist lahkuda ja põhjus on selles, et see läheb Matrix Escape'is hävitamisele. Kangelane soovib leida nn tagaukse ja selleks on vaja väga kiiresti liikuda. Maatriks on sihikindel; see püüab kõik teed ära lõigata. Kõik, millele saate loota, kaob silmapilguga, nii et te ei saa sekundi murdosagi viibida, vaid liikuda pidevalt edasi, hüpates ühest plokist teise. Matrix Escape'is vajate osavust, paindlikkust ja kiiret reageerimist.