Uue veebimängude idude tapja 2 teises osas aitate jätkata oma kangelasel võidelda mikroobide vastu. Enne ekraanil on nähtav teie kangelane, kes jookseb mööda asukohta. Hüppamine takistuste, lõksude ja ebaõnnestumiste kaudu peab teie tegelane koguma münte punase ristiga. Nende valiku jaoks annab Germ Killer 2 teile mängus prille ja tegelane saab mitmesuguseid tugevdusi. Olles kohtunud mikroobidega, peate need hävitama ja selleks saab ka prille.
