Kloostrist, kus meie ninjakangelane elas ja õppis, varastati väärtuslikke rulle. Maagiline riis on trükitud õhukesele riisipaberile. Taevaimpeeriumi valitsejaks võib saada igaüks, kes neid loeb. Väärtuslikke esemeid on sajandeid hoitud vahemälus, kuid keegi suutis need varastada ja ära viia. Sensei saatis oma parima õpilase otsingutele, kuid ilma sinuta ei saaks ta Ninja Runis hakkama. Selle mehega ei puutu kokku mitte ainult halvad inimesed, vaid tõelised kurjad samurai deemonid allmaailmast. Elu jooksul olid nad osavad sõdalased ja pärast surma hakkasid nad kuradit teenima ning nende võimetele lisati maagilisi oskusi. Ninja peab vaenlastega toime tulemiseks jooksma, hüppama ja terastähti viskama.