Pole juhus, et ninjad eelistavad riietuses musta värvi. See võimaldab sõdalastel varjuda varju või pimedusse, rünnates vaenlast ootamatult. See taktika aitab teie tegelasel kaasaegse metropoli tingimustes ellu jääda. Kangelane peab võitlema salaagentidega, kes on tegelikult tapjad, sest nad teevad salajasi missioone kogu maailmas, kõrvaldades soovimatud. Ninja ei tunnusta käsirelvi ja tema vaenlased kasutavad täielikult kõike, mis laseb. Seetõttu on ründamiseks ja löömiseks oluline olla kiire. Mängus Shadow Ninja on suurepärane relvavalik: tuline ei, jäämõõk, lahingukirves. Tuleb ka ebatraditsioonilisi, nagu tavaline kärbsevaip, mis kogenud võitleja käes muutub surmavaks relvaks.
