Fruit Ninja naaseb ja kutsub teid proovima oma reaktsiooni küpsete puuviljadega, mis on segatud pommidega. Fruit Ninja VR sisaldab kolme režiimi. Esimene neist on arkaadmäng, mis tähendab, et teil on aega ettenähtud aja jooksul maksimaalsete punktide saamiseks. Teine on Zen, selles pole ajalist piirangut, mängite lõputult, kuni teete vea: lõikate pommi või jätate puuvilja puudu. Kolmas režiim on kõige raskem, mille korral ilmuvad põllule korraga mitu vilja ja nende seas on pomme, mida on raske mitte kätte saada. Kõigil režiimidel on kolm tärni. Need kustuvad, kui märkate märkamata sihtmärki või tabate lõhkeainet.