Eakas ninjameister Kyoto otsustas anda endale oskustreeningu. Mängus Fruit Ninja liitute temaga selles. Teie ette ilmub ekraanile ruum, kus teie tegelane viibib. Signaali peale hakkavad viljad erinevatest suundadest välja lendama. Nad kudevad erinevatel kõrgustel ja lendavad erineva kiirusega. Sinu ülesandeks on kõik need puuviljad tükkideks lõigata. Selleks vaadake hoolikalt ekraani. Niipea kui viljad ilmuvad, hakake lihtsalt hiirt nende kohal liigutama. Seega lõikad puuviljad tükkideks ja saad selle eest punkte. Aga ole ettevaatlik. Viljade vahel võivad varitseda pommid. Kui puudutate neid, toimub plahvatus ja te kaotate taseme. Seejärel peate mängu Fruit Ninja uuesti läbima.