Sõjas püüab vaenlane hävitada eelkõige sõjalisi objekte: lennuvälju, sõjaväeosasid, laskemoonaladusid. Mängus Atomic Fighter 2D võtate lahingulennuki juhtimise enda alla, et kaitsta sõjaväebaasi kohal olevat taevast. Sellele läheneb juba eskadrill vaenlase ründelennukeid ja pommitajaid. Teie ülesandeks on hoida kaitset ja rünnata aktiivselt vaenlast kogu rindel. Liigutage hävitajat vasakule või paremale, eemaldudes mürskust lendavate vaenlase lennukite suunas ning rünnake ja tulistage ise, hävitades lennukeid ükshaaval. Koguge lennult erinevaid boonuseid, need aitavad teil mängus Atomic Fighter 2D toime tulla suure hulga edasiliikuvate vaenlastega.