Väikese Jaapani küla elanikke rõhub pidevalt kohalik aristokraat. Läbi Jaapani reisiv samurai otsustas neid aidata. Selleks peab ta tungima aristokraadi valdusse ja hävitama selle. Mängus Mini Samurai Kurofune aitate samuraid selles seikluses. Teie kangelane peab pääsema mõisasse, mida valvavad palgasõdurid ninjad. Nad ründavad teie tegelast. Teie kontrollite kangelase tegevust ja võitlete nende vastu. Osavalt mõõka vehkides ja käest-kätte võitlustehnikaid kasutades peate hävitama kõik oma vastased. Selle eest antakse teile mängus Mini Samurai Kurofune punkte. Pärast vaenlase surma koguge trofeed, mis temast välja kukuvad.
