Kõik, kes on merel käinud, on kindlasti meduusid näinud. Need on veesambas ujuvad tarretisesarnased olendid, paljud neist kipitavad valusalt, mistõttu puhkajatele meduusid liiga ei armasta. Kuid mängus Flappy Jelly aitate ühte neist ja see on täiesti kahjutu meduus, nii et ta peab end varjama arvukate vaenlaste eest, kes kõigil veealuses maailmas on. Vahepeal peavad meduusid end piirkonda läheneva tormi eest peitma. Ta ei taha üldse lainetes hängida, mistõttu otsustas ta sügavamale ujuda, kuid sattus mõne iidse templi varemete vahele. Aidake meduusidel ületada marmorist sammast, mis ulatuvad välja Flappy Jelly üla- ja alaosast.