Fruit Ninja puuviljad ei ole mõeldud söömiseks salatitena või lihtsalt lõbu pärast. Ninjamängu kangelane kogus hunniku puuvilju, et mitte kaotada oma oskusi katana mõõgaga. Kangelane töötab kohvikus kokana, mõni aasta tagasi lahkus ta kodumaalt mitte omal tahtel, vaid varjates end kohaliku maffia eest. Kuid maffia käed on pikad ja nad võivad ta igal ajal leida, mis tähendab, et peate olema valmis ja vajate koolitust. Ja kuna spetsiaalseid spordivahendeid pole käepärast, peate kasutama puuvilju. Assistent viskab arbuusid, banaanid, õunad, kiivid ja muud puuviljad ning sina lõikad need Fruit Ninjas.