Pärast mitmeid inimtegevusest tingitud katastroofe on planeetide ökoloogia oluliselt halvenenud ja inimestel on muutunud raskeks elada. Ilmusid mutandid, kes kohanesid kiiresti uute tingimustega. Nende veri võib saada aluseks vaktsiini loomisel, mis aitab tavainimestel saada tugevamaks ja tervemaks. Mängu Mutant Blood kangelane on maailmakuulus teadlane, kes ühendas kõik planeedi targad pead, et luua vaktsiin. Töö on alanud kõigis salalaborites, kuid ilmunud on neid, kes tahavad Mutantblood protsessi sekkuda – need on äärmuslased.
